MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 34771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011134	T	6	6	252	257	0 %	100 %	0 %	0 %	195977157
2	NC_011134	AGCT	2	8	273	280	25 %	25 %	25 %	25 %	195977157
3	NC_011134	T	6	6	311	316	0 %	100 %	0 %	0 %	195977157
4	NC_011134	ATG	2	6	321	326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977157
5	NC_011134	CAA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977157
6	NC_011134	T	7	7	363	369	0 %	100 %	0 %	0 %	195977157
7	NC_011134	A	7	7	396	402	100 %	0 %	0 %	0 %	195977157
8	NC_011134	CAG	2	6	423	428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977157
9	NC_011134	GAG	2	6	473	478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977157
10	NC_011134	ATT	2	6	485	490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977157
11	NC_011134	CAG	2	6	546	551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977157
12	NC_011134	TGA	2	6	601	606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977157
13	NC_011134	TGC	2	6	622	627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977157
14	NC_011134	GGA	2	6	683	688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977157
15	NC_011134	TTA	2	6	786	791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977157
16	NC_011134	TGT	2	6	799	804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977157
17	NC_011134	TCC	2	6	861	866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195977157
18	NC_011134	TGA	2	6	871	876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977157
19	NC_011134	A	7	7	893	899	100 %	0 %	0 %	0 %	195977157
20	NC_011134	AAC	3	9	950	958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977157
21	NC_011134	ATC	2	6	993	998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977157
22	NC_011134	AGC	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977157
23	NC_011134	GAA	2	6	1313	1318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977157
24	NC_011134	CA	3	6	1381	1386	50 %	0 %	0 %	50 %	195977157
25	NC_011134	TGCT	2	8	1395	1402	0 %	50 %	25 %	25 %	195977157
26	NC_011134	GGA	2	6	1472	1477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977157
27	NC_011134	AATTGA	2	12	1549	1560	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	195977157
28	NC_011134	TTCA	2	8	1772	1779	25 %	50 %	0 %	25 %	195977158
29	NC_011134	CAG	2	6	1807	1812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977158
30	NC_011134	TTG	2	6	1940	1945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977158
31	NC_011134	T	6	6	1982	1987	0 %	100 %	0 %	0 %	195977158
32	NC_011134	GGT	2	6	2050	2055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977158
33	NC_011134	TGC	2	6	2194	2199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977158
34	NC_011134	GTC	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977158
35	NC_011134	GA	3	6	2365	2370	50 %	0 %	50 %	0 %	195977158
36	NC_011134	GAT	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977158
37	NC_011134	TGA	2	6	2508	2513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977158
38	NC_011134	AC	3	6	2541	2546	50 %	0 %	0 %	50 %	195977158
39	NC_011134	GTG	2	6	2690	2695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977158
40	NC_011134	GAT	2	6	2828	2833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977158
41	NC_011134	AG	3	6	2836	2841	50 %	0 %	50 %	0 %	195977158
42	NC_011134	TGAAA	2	10	2979	2988	60 %	20 %	20 %	0 %	195977159
43	NC_011134	A	6	6	3021	3026	100 %	0 %	0 %	0 %	195977159
44	NC_011134	GTC	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977159
45	NC_011134	ATG	2	6	3274	3279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977160
46	NC_011134	AAG	2	6	3301	3306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977160
47	NC_011134	TCT	2	6	3570	3575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977160
48	NC_011134	TTG	2	6	3601	3606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977160
49	NC_011134	GT	3	6	3608	3613	0 %	50 %	50 %	0 %	195977160
50	NC_011134	CAG	2	6	3733	3738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977161
51	NC_011134	GCT	2	6	3807	3812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977161
52	NC_011134	TGGTA	2	10	3845	3854	20 %	40 %	40 %	0 %	195977161
53	NC_011134	A	7	7	3903	3909	100 %	0 %	0 %	0 %	195977161
54	NC_011134	TGA	3	9	4043	4051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977161
55	NC_011134	AATT	2	8	4126	4133	50 %	50 %	0 %	0 %	195977161
56	NC_011134	AATC	2	8	4147	4154	50 %	25 %	0 %	25 %	195977161
57	NC_011134	A	6	6	4177	4182	100 %	0 %	0 %	0 %	195977161
58	NC_011134	A	6	6	4234	4239	100 %	0 %	0 %	0 %	195977161
59	NC_011134	GAA	2	6	4254	4259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977161
60	NC_011134	GAT	2	6	4290	4295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977161
61	NC_011134	A	6	6	4300	4305	100 %	0 %	0 %	0 %	195977161
62	NC_011134	TTA	2	6	4323	4328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977161
63	NC_011134	TGA	2	6	4361	4366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977161
64	NC_011134	GCA	2	6	4422	4427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977161
65	NC_011134	AGA	3	9	4466	4474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977161
66	NC_011134	GAT	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977161
67	NC_011134	GTGC	2	8	4614	4621	0 %	25 %	50 %	25 %	195977161
68	NC_011134	ATG	2	6	4717	4722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977161
69	NC_011134	GTC	2	6	4765	4770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977161
70	NC_011134	AGGA	2	8	4777	4784	50 %	0 %	50 %	0 %	195977161
71	NC_011134	AT	3	6	4790	4795	50 %	50 %	0 %	0 %	195977161
72	NC_011134	TAG	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977162
73	NC_011134	CAAA	2	8	5043	5050	75 %	0 %	0 %	25 %	195977162
74	NC_011134	AGA	2	6	5111	5116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977162
75	NC_011134	TTG	2	6	5134	5139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977162
76	NC_011134	ATCA	2	8	5151	5158	50 %	25 %	0 %	25 %	195977162
77	NC_011134	ATTT	2	8	5166	5173	25 %	75 %	0 %	0 %	195977162
78	NC_011134	AAT	2	6	5196	5201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977162
79	NC_011134	ATG	2	6	5269	5274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977162
80	NC_011134	G	6	6	5325	5330	0 %	0 %	100 %	0 %	195977162
81	NC_011134	ATT	2	6	5349	5354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977162
82	NC_011134	TTA	2	6	5425	5430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977162
83	NC_011134	GAT	2	6	5457	5462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977162
84	NC_011134	CAAT	2	8	5470	5477	50 %	25 %	0 %	25 %	195977162
85	NC_011134	TAT	2	6	5511	5516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977162
86	NC_011134	A	6	6	5524	5529	100 %	0 %	0 %	0 %	195977162
87	NC_011134	GCA	2	6	5546	5551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977162
88	NC_011134	ATT	2	6	5581	5586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977163
89	NC_011134	AGC	3	9	5674	5682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977163
90	NC_011134	GTG	2	6	5723	5728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977163
91	NC_011134	CTTG	2	8	5776	5783	0 %	50 %	25 %	25 %	195977163
92	NC_011134	T	6	6	5804	5809	0 %	100 %	0 %	0 %	195977163
93	NC_011134	GAT	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977163
94	NC_011134	CTG	2	6	5820	5825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977163
95	NC_011134	T	6	6	5884	5889	0 %	100 %	0 %	0 %	195977163
96	NC_011134	CAG	2	6	5969	5974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977163
97	NC_011134	AAG	2	6	6026	6031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977163
98	NC_011134	T	6	6	6149	6154	0 %	100 %	0 %	0 %	195977163
99	NC_011134	TGA	2	6	6157	6162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977163
100	NC_011134	TC	3	6	6203	6208	0 %	50 %	0 %	50 %	195977163
101	NC_011134	AAG	2	6	6212	6217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977163
102	NC_011134	GGA	2	6	6262	6267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977163
103	NC_011134	AGC	2	6	6297	6302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977163
104	NC_011134	GGA	2	6	6337	6342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977163
105	NC_011134	AAG	2	6	6360	6365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977163
106	NC_011134	AATG	2	8	6413	6420	50 %	25 %	25 %	0 %	195977163
107	NC_011134	T	6	6	6458	6463	0 %	100 %	0 %	0 %	195977163
108	NC_011134	GAT	2	6	6464	6469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977163
109	NC_011134	AGTT	2	8	6477	6484	25 %	50 %	25 %	0 %	195977163
110	NC_011134	TTG	2	6	6521	6526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977163
111	NC_011134	GAT	2	6	6530	6535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977163
112	NC_011134	ACA	2	6	6538	6543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977163
113	NC_011134	ATT	2	6	6567	6572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977163
114	NC_011134	CTT	2	6	6616	6621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977163
115	NC_011134	TCAA	2	8	6702	6709	50 %	25 %	0 %	25 %	195977163
116	NC_011134	TGA	2	6	6724	6729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977163
117	NC_011134	TCA	2	6	6781	6786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977163
118	NC_011134	CTG	2	6	6846	6851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977163
119	NC_011134	ATT	2	6	6881	6886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977163
120	NC_011134	TGA	2	6	6916	6921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977163
121	NC_011134	AT	3	6	6950	6955	50 %	50 %	0 %	0 %	195977163
122	NC_011134	CGT	2	6	6971	6976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977163
123	NC_011134	TCG	2	6	6979	6984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977163
124	NC_011134	T	6	6	7075	7080	0 %	100 %	0 %	0 %	195977163
125	NC_011134	CAG	2	6	7139	7144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977163
126	NC_011134	AGC	2	6	7170	7175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977163
127	NC_011134	CAG	2	6	7200	7205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977163
128	NC_011134	TAA	2	6	7225	7230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977163
129	NC_011134	AGCAA	2	10	7255	7264	60 %	0 %	20 %	20 %	195977163
130	NC_011134	GAT	2	6	7355	7360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977163
131	NC_011134	CGA	2	6	7405	7410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977163
132	NC_011134	A	6	6	7436	7441	100 %	0 %	0 %	0 %	195977163
133	NC_011134	GCT	2	6	7520	7525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977163
134	NC_011134	CAA	2	6	7569	7574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977163
135	NC_011134	CAG	2	6	7586	7591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977163
136	NC_011134	A	6	6	7664	7669	100 %	0 %	0 %	0 %	195977163
137	NC_011134	A	6	6	7696	7701	100 %	0 %	0 %	0 %	195977163
138	NC_011134	ATT	3	9	7715	7723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977163
139	NC_011134	T	6	6	7755	7760	0 %	100 %	0 %	0 %	195977163
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149	NC_011134	TAT	2	6	8206	8211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977163
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